این یک واقعیت پذیرفته شده و بدیهی است که مهمترین هزینه ای که شرکت ها در حوزه دانش بنیان انجام می دهند، برای تحقیق و توسعه محصولاتشان است. در هر کدام از زمینه های علمی پذیرفته شده در دانش بنیان این هزینه ها می تواند شامل فعالیت ها و نیازهای متفاوتی باشد، بنابراین تبیین برنامه ای که بتواند به طور کامل تمامی آنها را پوشش دهد کار آسانی نیست. با بالا رفتن هزینه های کشور به خاطر تورم و افزایش قیمت دلار، امروز مجموعه هایی که در این خصوص فعالیت می کنند با مشکلات هزینه ای متعددی دست و پنجه نرم می کنند.